纳塔尔折背陆龟是的背甲并不是一个整体，而是产生了“关节”，这种构造可以帮助其在遇到危险时保护自己、躲避天敌，这也是折背陆龟所有龟种共同具备的特点，就像中国的闭壳龟腹甲可以活动一样，只不过折背陆龟是背部可以活动。
纳塔尔折背陆龟最大甲长15.5公分，下摆较宽呈锯齿状切外翻，上臀盾分成2枚，具有3个钩装上颚由于色彩差异极大，个体间不太可能出现相同的背甲斑纹及花样。纳塔尔折背陆龟属于折背陆龟中体型较小的种类，雌性个体的成熟体型也不过15-18vm左右。
纳塔尔折背陆龟最大的特点就是位于背甲第7与第8缘盾间，类似于韧带或是绞键般的柔软构造，而这种可以活动的特殊构造，在个体遭遇敌害攻击时，可以藉由肌肉的收缩，来牵动韧带让壳甲闭合，藉由此种特殊的构造，个体的尾部与后肢可以缩到壳甲内，以躲避掠食者的攻击。